Warning! We strongly recommend Internet Explorer (9.0 and later) and Google Chrome for better display.

Gene detail [Fasta]

Species Dendroctonus ponderosae
GeneDPO011404
PositionSeq_1102332:29474..37805[GBrowse]
sequence mRNA:
>DPO011404-RA
GAGACAAGTCTTTTATCTCTGCTGTGAAAGTCATCTGGTGCTTTGTACTTTTAGGATTTTGTTTTCCCTTCGTTTTACGT
GATTTCCTGCACGTCTTTTCCTACTGGAAAGAGCTAATTGAAATAATGAAGGTAATGTGTTTATTTAACTGTTTAGTTGG
ATGGTTGCATCCACCTGCCCCGTCCGAGAATCGGCTGGGATTAAATTAATGCGCGTTTCAGTTTGGTGTGGCTCATAAAC
AACATATTTTTGATTTTCTCCGCGGAATCTGCCTCCTACTGATATATTAGCCGGTCATTGTTTCTCTATTTTAGTATTTC
AACAGCATTCGCATTGTTTGTATCGATACTGGTCGGTGTAAATAGTGCAGTGGTTGATCAAAATTTTGTGAAAGTTCTCC
AAGACATTTTCGGCCATGATTCAATTCGAGGTCAGGGAACCACCGGGCTCACAACGACGTAAATATCCGTTTTTTATTTT
TCTTAGATTTTCATTGGCTCATTCCACTTGGAAACTGCTTATAAATATTCACAAACGCAAATATTCTCAACGATTTAAAA
TTTTAGTGTCTCATCATATTCTTATCAGGCATTTCAAGGTTTTTTGGTCTGATATCCATTTGTTTTTGTCAACAATAGAT
TGTCATTTAGCTGTTTTACTTTATTTAATCTGCATTTATTCAATTATACAACATTTACTCAACACATCCAGAGATAGACT
CTTTGATGAATTATTTTCGTTTAAGTACATTGATTATTTATCTTCAATAGTCCAGAGTGAATGTGCACCTTTTGCAATTA
ACATTAATTTAATATGGGTCATGGCGCTCTTCTCAGGCTGGCTATTGGAAATATAACAGATGGTATAAAACTCCGTTGAA
AAAACTTTGTTCTTGAGCATGCATAGTAAAATTTATAAAATACGAAATTTTTTAAAATTTATCAGTAGGCTCAAAGAACT
TTAAATTTCTAGCGTACACTTACGTTACTTACTTACTGTTACGTACAAGTTTTAATTGTTAAATATCGTCGTTATTGGAA
TATTTTTATTTCCCCTCCAAAGATCGTCTTATTGGAATAAATAGACGATTCAATAATAGGTAGTTAGGTATGTAAAGTTT
CAAAGAAAAACCCATCGAAAATTTTGCCTTGGACTTTTCTCATTGTTTTTTCTGCAAACCAAAATGTAAACTTCTAAATA
AGGCCGATAAATGCGTTTTACCTTGTCCTGGTTTATTCACACACAGTTTGTCGGTTTTAGCCATTTGTTGATTGGGTTTC
AGTATTATTTAAAAATATACATATGTTGTGTCTAAAATTCATTTTGAATAATAACATAAATTCAGAAAAACTATTTCCTT
GTTGTACTGAATAGTTCTAATAATAAAAATTACATAGAAGTTTACTTTTGAAATTTCAGAAGAGAAATTTCAAAAGTGTA
TCAATTGAAAGGTTTTCTAAAAATGGGATAAAAATGTTAAATACATGAAAAGTACCATGAATAAAAGCTTGTAATTTTTT
TTTCTTCAAAAGAAAAATTGTTTGAAACTAATCAACTTAAAAAAAGAGATTTAAAAATATCCAATGCTTCCAGGACCTTC
CAACGTCAGGAACAAATTATATTCTAAGACGGCCTAAAAGCCCAAAAACTCACTAGTTTCAATGTGCGTTTTTCTGGTCA
CTCTTTTGGTCACCTTCTGACTAGCTAATATGAAAAGCGTATATGTGCTTTCTCACGTAATTCCTCATGTGGCTTGTTAT
CGCTTTATTAACCAATAAGGGCATATAACACATGAATTTTAACTTTTTTAATTTTACACAATAAATTGTGTAAAACACAC
AATTTTAAATTTTAATTTCGATATTTTATATACTTTTATATATATTGCACATTTTTTCTTTGTTTTTCTCAAGTAAATGT
GCGCAGCAATAATCTGAAAAGTTATTTTCTCAGCTTCAGCCAGGAAAATAGGTTAAAATATAAATGACAATATTTATTAA
CTTCCGTCCCCAAAGCAGCCGCCCACTCTCCAACTATGTTTACTATTCAACTGATTGAAGCATCTTTAAAAATATATCAC
TAACCAAGTAAATAGCTAATGGAACGGCGCCCCCACATTAGAAGAAATCAATCCAAATCGATTTTTAAAACCGGAGAAAT
TATGCAGTTAAATCGCGCAAAATTGGTGACGAAAAGTCCTTGTCCTCAATTTGTTTGTTATCTTTAGTTACAATTTAAAT
TATTTTAATTGTTAATTAAAATTCGAAAACAGGAAAATGTTTTTTTTTTTAATAATTAATTGAGAACTTATATGAGTAAT
CAGTTATTAATATATCTTTTTATTTCCAGTGTCGTTCCTAGGCAAGTTATCCTCAAACATGAACTCTCTAGCGAGTGAAT
CGAAGAAGAGGCACAGTTTCGAGCGGGGATCTCCTTTGATTTTGCCTTCTCTTCAAGAAGATCCCAGAATCATGGGCAAA
GACTTCGATAACACGAAAATATTGGACATTTATCCGTCAATTACCGGCGATCTGCAATCTTTAATAATAGGAGCTGATGA
GCCTGAACATAATGGGCAACGGGGCATTCTTCTAATCGACGACAACGAAACGCTCAGAATTGAATCAGATACTGCATTTT
CTAAGGCTCTGAATATCGAGCTTGATAAAAAGATTAAAGTTGTGTCGATTTTCGGAAATACTGGTGTAGGCAAGTCCTAT
ACCTTAAATAAGTTATTTTTCAATGGTGAGGAAGTGTTTAAAACATCCCCTTCGCAAGTGTCCTGTACGTTGGGGGTATG
GGCAAAATATGATCCCACATTGAATGTACTTTGTCTCGATACTGAAGGATTATTAGTATCGGACATAATAATCTATCGTA
CCAGATCGGAAAGGCTACAACGGGACATGTACTCCTTTTTGGGGGGTGCATCTAATGTATATAAACAACATTTCTATACA
GCGCTTCAGAAAACCCTCGCTCGATCTGATGGAGAGAAAATCAATGCAGGATTGGCCCCTGGTGTGATCATATTTCACGA
AACACAATATACTGATACTCTTCATGTTTTGAACAATCACCCGAACGTAACAGCTGAAGACATTTTGCGACAAAACTTTG
CCGATTTGGGGTCGAATTGTGAAGAGTTCAGCTTTATTAAATATATTGGTGTAAAAACTCGAGATAACCAAGAGACGTCG
TTCGATCGTCTCAGAGCCGAAATTCAAAAGGAATTAGAGAGTTCCAACGTGCGATCGGCCAGAAAGGCCAAATACGTATA
CCTAATGCTTAAAAGTCTGAATGATAAGTTTTTTTCTCCACTCACTGAGTCAAATCACGAGCAGTTTTTGGCTCAATTTT
TCACATGCCCGGAAAAGTGCCAATCATGCAGTGCGAGTTGTGTGCTTTCTACTGGCCATAAGGAAGATGATGAGCCTCAT
AAGTGCAATACGCCCTGCAAATTCCAACACCAATATCAAAACTTTGTGTATTTATGTGAGAAATGTGTTAGAAATGGGGA
AAGGTCTACGGTTGAACCTAAATACACCAAAGATAATTCTTGGACATCATACCTGAATTTGATGTGGTCAGGGTATGTTA
TCCATTGTCCGAAATGCGGAGTAATCTACAAAAGCCGAGAGCACTGGTATGGAAACAAAAATCCTGAAGACTGTGCGGTG
CAGCTGGAAGTCGTCCACATGTGGCCAGGAGAATACGTCAGGCCAAGTTACTGGACGCCAGACAGTGAGTGCATCAATTG
TGTGTTGTGTAATAATCCCTTTGGCACCCAGTTACCTTTACATCATTGTCGAGATTGCGGTAAGGGCGTTTGCGACAATT
GCTCAACGTCTAGAAAGCCCGTTCCCGTGAAGGGTTGGGACTCGCCGGTTAGAGTTTGCGATACTTGTCGGTAAACGATT
AGTAAAGTTAAAAAGAATTAACTTTTACTCAATCGTTTACTGAAGCATAAAACATAAATAAACTATGCAGGTGGTATTCA
TGTTTTTTATGTTTTAAGACCAAGAATGGCTGTATATTTGTTACGGATGATCAAAATGCCTATAAGCAATCCACTAAGAT
AAGACGGATCTTTTTTCTTTATACACTCAAACAAGCTCAGAATGGACAAATTAATAGTACGCTTGGTAATTTAGGGCTAT
TTTTTTGTTTTACAACAGTTATTACATACCAACTCCAGTCATAAAAATACTGCGAGTCGTAATAGTATTATGATGTCATT
TATTCAAATCTTATCAGTTTGCTTGTTACATTATAAAAGAATCCATATCATAATTGAAACCTTTACATGTGAAACGGGGG
TTGAAAGATAAAATAAGGTTTTGGATTTGAAACTGCACCTGTTAAACATTGACATTTTTTATTTTTTATTAATGGACTTT
AAGTAAGGTATTAGACAGGTTCTCTCCTATGAAATTAAAAATATATTTTTTTGAGAATTTGTATGAACTAGCACCAAATA
CAGATAGGACATTCCAAATGTTTGGAAGCATTTAGACAGTTTTTACTTTGATAATATGTGCGAGTGCCATTGCTTTAGGA
AAATAATACAAAAAATGCATTGTGAGTAATCGATTGTTATACAATAAACCGAATTGAACAAAA
PEP:
>DPO011404-PA
MNSLASESKKRHSFERGSPLILPSLQEDPRIMGKDFDNTKILDIYPSITGDLQSLIIGADEPEHNGQRGILLIDDNETLR
IESDTAFSKALNIELDKKIKVVSIFGNTGVGKSYTLNKLFFNGEEVFKTSPSQVSCTLGVWAKYDPTLNVLCLDTEGLLV
SDIIIYRTRSERLQRDMYSFLGGASNVYKQHFYTALQKTLARSDGEKINAGLAPGVIIFHETQYTDTLHVLNNHPNVTAE
DILRQNFADLGSNCEEFSFIKYIGVKTRDNQETSFDRLRAEIQKELESSNVRSARKAKYVYLMLKSLNDKFFSPLTESNH
EQFLAQFFTCPEKCQSCSASCVLSTGHKEDDEPHKCNTPCKFQHQYQNFVYLCEKCVRNGERSTVEPKYTKDNSWTSYLN
LMWSGYVIHCPKCGVIYKSREHWYGNKNPEDCAVQLEVVHMWPGEYVRPSYWTPDSECINCVLCNNPFGTQLPLHHCRDC
GKGVCDNCSTSRKPVPVKGWDSPVRVCDTCR
Swiss-ProtZinc finger FYVE domain-containing protein 1
KEGG     K17603     
SUPERFAMILYSSF52540  P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily     
Gene3DG3DSA:3.30.40.10     
PfamPF02263  GBP; Guanylate-binding protein, N-terminal domain     
SMARTSM00064     
ProSiteProfilesPS50178  ZF_FYVE; Zinc finger FYVE/FYVE-related type profile.     

You might be interested in these researchers

You might be interested in these references