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Gene detail [Fasta]

Species Solenopsis invicta
GeneSINV17099
PositionSi_gnF.scaffold07457:57020..61258[GBrowse]
Ant Genomes Portalhttp://hymenopteragenome.org/cgi-bin/gb2/gbrowse/sinv_10/?name=SINV17099
sequence mRNA: 
>SINV17099-RA
ATGGAAACCATTATCTTAAGTTGCTTTGCACGCTTTGCTAAAAATCGTGTAATATTTAAAAGTGATCTTAGGTGTATCCA
ACATAATTTAGAAGTAGATTCATTCTCAATATCAGTACCTGACAAAATATGGAGTATAAACGAGTTAACGGAAGAGGAAT
TACGTAATTTACATGTCGAATTTGATTACGAACCCTTGGAGGAGCGATGGTGGGAACAGGAGCCGCTGCAGGTGCTAGAT
CTGAGCTTTAATAGTTTAACTCTAATTGATGAAAAAGTACAATTTCTAACTGAACTGAGTACCTTGGACGTACGTATAAA
TCATTTATACTGTGATTTTAAAAGTGCGTTGAACAACAATTTGTTAGAAAAATTACCAGCAGAAATCGGTTCTCTGCGCA
GACTAAGAATAATAAATCTATCGGACAATAAGCTAAAAAGTTTACCTTATGAATTTTACACGTTGGAAGAGTTATGCGAG
TTATATCTAAAAAATAATCTTTTAAGTATACTCGAGCCTGAGATCGGGAATTTAATCATGTTAACTCATATGGATTTATC
ATATAATAATTTAAGTGAATTACCAATTGGAATGGGATACATGGTGCGGCTAGAGACATTGAATTTATGTCACAATATGA
TAAAAGAGTTACCACCTGATGTAACAACATTAAAAACATTAGATATCAGCTTTAATCATTTGGAGATTATACCACCGTTA
GGTGAATTGCGAAAAGTAGAGAGAATTATGTTCCAATCGAATAATTTACAGGAATTTCCAGACATATCAGGTTGTTCAGC
TTTAACAGTATTGCATTTGGATAACAATAATATTCCTGTATGTGTTAATGAGATTGATCCACAACGCTTGGAAGCAATAG
GGCATCTAAAAAAGCTCACGTTGCAAGGCAATAAAATTGAATTGATACCCGAGGAAATAGTCAAACTGATAAATTTAGAA
GTTCTTGACTTGTCGCACAATAATATAACTTTGATACCTTTTTGCATTGGTATATTGCCAAATTTAAAGCAATTTGTAAT
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TTGTAGATAATAATACAAGTGTAATCACTAGAGAATTGTTACAACCCTGCGGTGGCAATAATATTTATCCCGATAAATAC
GTGATGAAGCATACAAAGCTGTTTAGCTTAACTGGACAAAATCTTGTGGAAATATCCGAAGAGATCTTAGAAGATGCAGC
AAACGCCTCCGTCACAATCATTGACTTAAGTAGAAACAAGCTATCGGAACTGCCGGATAAAATGTCGACGATCGTTACAG
TAACAGATCTAAAGTTAACTTCAAATCATTTAGCGAGTTTACCGGAATGGATTGGTGAAAAGTATAAGTTTTTGCAGATA
TTAGACTTAAGTACAAATCATCTGCAATCTCTACCGTCGAGTATCAGCTGCCTGAAATATTTGCGAGATATCGATCTCTC
ATTTAACAGTTCTATCGAGTCGGAATCCATAACTTGCTTGAAACATGAAGAAAAGTTCACTGAGTTACCAGAAGCTATCT
ATGACGTCGAATCTTTGGAAAGTCTAATTATCAATGACAATCTAATTTCAAAAATCGACGTGCCGCTTTTGGAAAAGTTA
AAACGGCTAGCAGTTTTAAATCTGATGAATAACAATATCTCTCACGTACCTCCTGAACTTGGTAACTTGAAAAACTTAAG
AAATCTATTGTTATCTGGAAATTGTTTCAAATATCCCAGGCAAGCAATTCTAATGAAAGATACAGAAGAAATACTGAGCT
ATCTACGTAATCTAATACCTCAG
PEP: 
>SINV17099-PA
METIILSCFARFAKNRVIFKSDLRCIQHNLEVDSFSISVPDKIWSINELTEEELRNLHVEFDYEPLEERWWEQEPLQVLD
LSFNSLTLIDEKVQFLTELSTLDVRINHLYCDFKSALNNNLLEKLPAEIGSLRRLRIINLSDNKLKSLPYEFYTLEELCE
LYLKNNLLSILEPEIGNLIMLTHMDLSYNNLSELPIGMGYMVRLETLNLCHNMIKELPPDVTTLKTLDISFNHLEIIPPL
GELRKVERIMFQSNNLQEFPDISGCSALTVLHLDNNNIPVCVNEIDPQRLEAIGHLKKLTLQGNKIELIPEEIVKLINLE
VLDLSHNNITLIPFCIGILPNLKQFVIEGNNITNVRGDIIRCGTPRILTHIRQIVDNNTSVITRELLQPCGGNNIYPDKY
VMKHTKLFSLTGQNLVEISEEILEDAANASVTIIDLSRNKLSELPDKMSTIVTVTDLKLTSNHLASLPEWIGEKYKFLQI
LDLSTNHLQSLPSSISCLKYLRDIDLSFNSSIESESITCLKHEEKFTELPEAIYDVESLESLIINDNLISKIDVPLLEKL
KRLAVLNLMNNNISHVPPELGNLKNLRNLLLSGNCFKYPRQAILMKDTEEILSYLRNLIPQ
Swiss-ProtLeucine-rich repeat-containing protein 40
SUPERFAMILYSSF52058  L domain-like superfamily     
Gene3DG3DSA:3.80.10.10     
PfamPF00560  LRR_1; Leucine Rich Repeat     
SMARTSM00369     
ProSiteProfilesPS51450  LRR; Leucine-rich repeat profile.     
PRINTSPR00019     

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