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Gene detail [Fasta]

Species Danaus plexippus
GeneDPOGS201465
PositionDPSCF300006:221471..223896[GBrowse]
MonarchBasehttp://monarchbase.umassmed.edu/tools3/Get_gene.cgi?id=DPOGS201465
sequence mRNA: 
>DPOGS201465-TA
ATGCTTCTATTACGAACATCGGGAGTGCTTCTGTTGTTGTTGTTGTTGACAAATGCGGACTCGGACTTAGATGACAACTA
CGATATTTGCTTTCTGTGCTCATGTAACGCAGAACAAAACAGCGTTGATTGTTCCCATAGAGGGCTGACTATTCTTCCTG
ATGGGATATCCGTAAAAGTTTCGAAACTTAACATTTCCAACAACGACATCTCAATTTTTCCAACTAACCTCAGCAGACTA
TATAATTTAGTATCATTGGACATAAGTGGGAATCAAATAAATCAGTTGCCTGAAAATGCTCTTCAAAATCTTACAGCATT
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GTTCAAACCAAATTTAGCAGGATTTCCAAACCTAAGAAAAGCTATAATAAATCATAATATGATAAGATATCTAGGAAGCA
ACGAGTTTATAAATAATACAAAACTTGAATATTTAGATCTTTCCTACAATAACATAGGGTCTATAAAAGGCGATACTTTC
CGTGGACTTAATATGCTAAGGTTTTTAGATTTATCTTGGAATGAATTGGCTCAAATACCTGAAAATAGTCTCTTAGAAAT
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TCGATATGAGCTCATGTGAAATCAGTGTGATTGGAAAAGATTCATTCGAAGGCCTACCGTCGCTCATTGAAATGGACTTA
TCCCATAATCTTATATCCCACATACCTGACAGCATATCATCGAACACGCTGAAGTATTTGAATTTAAACTTTAACAGAAT
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TTTGGAGCAGATCGTATTTTGAATTTAATGTCAATTTGGATAGACTCGATTTGAGCGATAACATGTGGAGATGTGATTGT
CGTGATGACAACATGTATGATTTTTACGAGTTTGTTACTTTAGAACCAAACAAAAAAGAGGAATCTTATAATCTTATATG
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ATTAAGAATGCGAGCTGAACAAGAAGCGTTATGTAATACTCCAGATCCAAGGGATTTGATACAACCACCGTCGTATGATG
AAGCTCTCTCAATGCCAAAACTAAACGTATCCTGTCATTCGTTGAACGAAACCGGAACTGGCAAAAGTAAACGAAGAAGA
GGCAGGAGGAAAACTAAGTCAAGCGGAGATTTACTCGAAGAGACAGAAAGGAATGGAGATGTTCGGGTAGTTGGTGACAT
AGAATTGACTGAAACACCTAATATCGATGATAGACGGCGTCGGCGGCGTAACAGAAGATACGGCAGTCACGATATAGCAG
AACTCGATGATAGTCCTGGTGCGAGAAGGAGACGAATGTCCGCTGTCGAACCACATGAAAATAGCGTCATGCTGCAAGTT
GAAGCAGAATTAGAGACACCCAATAATCGACGGGTAGGCTTAAACGACAGTCACCCACGAGAAAGTGACTTTTAA
PEP: 
>DPOGS201465-PA
MLLLRTSGVLLLLLLLTNADSDLDDNYDICFLCSCNAEQNSVDCSHRGLTILPDGISVKVSKLNISNNDISIFPTNLSRL
YNLVSLDISGNQINQLPENALQNLTALEILNLSNNGFETWLSLNPNEVLKPAVKLKILDLSSNNLKTLANLANQELFISP
TLETLILNDCQIDAVYGRSPLSGLINIRVLKLDNNPLLRIQNLISPTLRSLYLSNCQLSYINNHELSYLPSLLYLKMSHN
YRLELSATSNSLFSESLKFLDISYCNVFKPNLAGFPNLRKAIINHNMIRYLGSNEFINNTKLEYLDLSYNNIGSIKGDTF
RGLNMLRFLDLSWNELAQIPENSLLEMPSVTQVKLARNYLNRVGHLKSTSITILDMSSCEISVIGKDSFEGLPSLIEMDL
SHNLISHIPDSISSNTLKYLNLNFNRISSLSNFTFFMMPHLTGLSVIGNRFTNIWSRSYFEFNVNLDRLDLSDNMWRCDC
RDDNMYDFYEFVTLEPNKKEESYNLICNSPINVIGQTWLEACYFAWYPDAKKGNADNLIYFIIVMVVGLSLCLIIVTAIR
RSLKHRLLVMQTERERQVEEARDRLRQLRMRAEQEALCNTPDPRDLIQPPSYDEALSMPKLNVSCHSLNETGTGKSKRRR
GRRKTKSSGDLLEETERNGDVRVVGDIELTETPNIDDRRRRRRNRRYGSHDIAELDDSPGARRRRMSAVEPHENSVMLQV
EAELETPNNRRVGLNDSHPRESDF
Swiss-ProtPodocan-like protein 1
SUPERFAMILYSSF52047  RNI-like superfamily     
Gene3DG3DSA:3.80.10.10     
PfamPF13855  LRR_8; Leucine rich repeat     
SMARTSM00369     
ProSiteProfilesPS51450  LRR; Leucine-rich repeat profile.     
CoilsCoil
OrthologiGroup-00785    Podocan-like protein     

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